RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 FLRT1Q9NZU1 646 aa26.06■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CAPN15O75808 1086 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 COPB2P35606 906 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 GRM4Q14833 912 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 APBA2Q99767 749 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 WDR19Q8NEZ3 1342 aa26.05■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 SEC24BO95487 1268 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 INHAP05111 366 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ICAM1P05362 532 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 FCER1AP12319 257 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CPA1P15085 419 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A3P48751 1232 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 CHST13Q8NET6 341 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 MMP19Q99542 508 aa26.03■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 ZNF654Q8IZM8 581 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 TMTC2Q8N394 836 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 MYL10Q9BUA6 226 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.02■■□□□ 1.76
SYF2-201ENST00000236273 KLRF2D3W0D1 207 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 HMGCRP04035 888 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 PGK2P07205 417 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 DPP9Q86TI2 863 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MTMR8Q96EF0 704 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MAP3K14Q99558 947 aa26.01■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 POTEFA5A3E0 1075 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 SOX10P56693 466 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 TKFCQ3LXA3 575 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 TRERF1Q96PN7 1200 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 UNC93B1Q9H1C4 597 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 HOMER2Q9NSB8 354 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RNF146Q9NTX7 359 aa26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CYTH3O43739 400 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 ALAS1P13196 640 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CCL5P13501 91 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 KCTD2Q14681 263 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 FBXO40Q9UH90 709 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.99■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 DDAH1O94760 285 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 UBXN2AP68543 259 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 C8orf34Q49A92 452 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 MAML3Q96JK9 1138 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 ACAD9Q9H845 621 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.98■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CCDC69A6NI79 296 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 FBXL16Q8N461 479 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 NUP133Q8WUM0 1156 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 FGD4Q96M96 766 aa25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RXRAP19793 462 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RPS6KB1P23443 525 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 QRICH1Q2TAL8 776 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 NFXL1Q6ZNB6 911 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.96■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 CYP2C19P33261 490 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RGS19P49795 217 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RNF208Q9H0X6 261 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 SLC12A7Q9Y666 1083 aa25.95■■□□□ 1.75
SYF2-201ENST00000236273 RPTORQ8N122 1335 aa25.95■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 NFIBO00712 420 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 PSMA5P28066 241 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 APOA5Q6Q788 366 aa25.94■■□□□ 1.74
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZUG5 572 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms