RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TRPV6Q9H1D0 765 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 TECTAO75443 2155 aa19.97■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 PFKMP08237 780 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 BEX3Q00994 111 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL17Q6UXB2 119 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 SLC9A7Q96T83 725 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 ASTN1O14525 1302 aa19.96■□□□□ 0.79
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf42Q9H799 3197 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 ICA1Q05084 483 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 ITGA7Q13683 1181 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 KATNBL1Q9H079 304 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SH2D4AQ9H788 454 aa19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 LEXMQ3ZCV2 418 aa19.94■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.94■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 GPR108Q9NPR9 543 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 LMCD1Q9NZU5 365 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa19.93■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 AKR1B1P15121 316 aa19.92■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 POTEBQ6S5H4 581 aa19.92■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.92■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 HERC6Q8IVU3 1022 aa19.92■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 ANKS1AQ92625 1134 aa19.92■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 TEX13BQ9BXU2 312 aa19.92■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 LCTP09848 1927 aa19.9■□□□□ 0.78
SPCS1-201ENST00000233025 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
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SPCS1-201ENST00000233025 ST18O60284 1047 aa19.89■□□□□ 0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 ACTN1P12814 892 aa19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 KCNA5P22460 613 aa19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 MYO7AQ13402 2215 aa19.89■□□□□ 0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 TLK2Q86UE8 772 aa19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 SWAP70Q9UH65 585 aa19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 MYH4Q9Y623 1939 aa19.89■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 KMT2EQ8IZD2 1858 aa19.88■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF536O15090 1300 aa19.88■□□□□ 0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa19.88■□□□□ 0.77
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SPCS1-201ENST00000233025 KIF28PB7ZC32 967 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 CYP2C9P11712 490 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 PTGS1P23219 599 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 TNFAIP2Q03169 654 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 DYNLL2Q96FJ2 89 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 FAM186AA6NE01 2351 aa19.87■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 DCHS1Q96JQ0 3298 aa19.86■□□□□ 0.77
SPCS1-201ENST00000233025 EEF2P13639 858 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
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