RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cct6bQ61390 531 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arid3aQ62431 601 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dbndd2Q9CRD4 158 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Snrnp35Q9D384 244 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc7Q9QYI3 494 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdh11xF6ZNL5 1338 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PfasQ5SUR0 1337 aa24.75■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ByslO54825 436 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prl2c3P04768 224 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tcp11Q01755 566 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccna1Q61456 421 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrn2Q6PHP6 730 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc1Q80VQ1 524 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpt2Q8BGT5 522 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Srgap2Q91Z67 1071 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nsrp1Q5NCR9 542 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Frmpd4A2AFR3 1320 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Heg1E9Q7X6 1337 aa24.74■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10378F6XQQ1 160 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alppl2P24823 529 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PRAG1Q571I4 1179 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef2Q60875 985 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pabpc4Q6PHQ9 660 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm1aQ6ZQ88 853 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zc3h6Q8BYK8 1177 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ushbp1Q8R370 680 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp2r5dQ91V89 594 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Capn2O08529 700 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mboat4P0C7A3 435 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stim1P70302 685 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q8C1R3 189 aa24.73■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif3cO35066 796 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc6O88978 473 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc44a4Q91VA1 707 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cacna1sQ02789 1880 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ggt6Q6PDE7 497 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trim9Q8C7M3 817 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CutaQ9CQ89 177 aa24.72■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7356A0A087WSA6 508 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r71L7N2D8 855 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tlr8P58682 1032 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdr2P97817 455 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 VrtnQ3SYK4 740 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Asic1Q6NXK8 526 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tubb2aQ7TMM9 445 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zmynd15Q8C0R7 736 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tubb2bQ9CWF2 445 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arl6ip4Q9JM93 229 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DonsonQ9QXP4 560 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc4bP0C192 709 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nol4P60954 483 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 OplahQ8K010 1288 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grin3bQ91ZU9 1003 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cbx8Q9QXV1 362 aa24.71■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfyve9A2A8R0 1397 aa24.7■■□□□ 1.55
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RaraP11416 462 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 FntaQ61239 377 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Alpk1Q9CXB8 1231 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Etnk2A7MCT6 385 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SarsP26638 512 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nap1l2P51860 460 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eya3P97480 510 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MmeQ61391 750 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hs2st1Q8R3H7 356 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk8Q8R3L8 464 aa24.7■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nck2O55033 380 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tsr1Q5SWD9 803 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc93Q7TQK5 629 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dydc2Q9D3X8 139 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ltbp2O08999 1813 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Enc1O35709 589 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Evi5P97366 809 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc9a2Q3ZAS0 814 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sema4bQ62179 823 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Irak1Q62406 710 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Jade2Q6ZQF7 829 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa24.69■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rasa2P58069 847 aa24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif22Q3V300 660 aa24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Stap2Q8R0L1 411 aa24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp1a1Q8VDN2 1023 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms