RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YSP3P25036 478 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CMK1P27466 446 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FTH1P38310 465 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PRM9P39551 298 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PSF2P40359 213 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data10.24□□□□□ -0.77not detected
PRP4YPR178W IMD3P50095 523 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CLD1P53264 445 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ARE2P53629 642 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W HXT15P54854 567 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ARP10Q04549 284 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YLL032CQ07834 825 aaKnown RBP RIP-Chip data10.24□□□□□ -0.77not detected
PRP4YPR178W UAF30Q08747 228 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YPL191CQ08930 360 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TY3A-GQ12173 290 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TY3A-IQ99219 290 aa10.24□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SUC2P00724 532 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GPH1P06738 902 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GIP4P39732 760 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W JLP2P40206 208 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W STB4P50104 949 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ALG11P53954 548 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W TOF2Q02208 771 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GAS3Q03655 524 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RAD33Q04231 177 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W AIM7Q12156 149 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CTF3Q12748 733 aa10.23□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W HEM2P05373 342 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W CDC31P06704 161 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MET16P18408 261 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W FUN30P31380 1131 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ACH1P32316 526 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PRP19P32523 503 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W DUR3P33413 735 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YKL100CP34248 587 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W MRP21P38175 177 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ECM8P38246 354 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W SWD1P39706 426 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RPS10BP46784 105 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YJR154WP47181 346 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W KTR6P54070 446 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YPL062WQ02781 134 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W PEX10Q05568 337 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W YPQ2Q06328 317 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W BBP1Q12365 385 aa10.22□□□□□ -0.77
PRP4YPR178W GLN4P13188 809 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W APE1P14904 514 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MRPL7P36519 292 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W FSH1P38777 243 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W DLD3P39976 496 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W HAT2P39984 401 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YEL028WP39989 153 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W EFM3P47163 339 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ISM1P48526 1002 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W KEL2P50090 882 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NCS6P53088 359 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W TWF1P53250 332 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YNR068CP53754 272 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SPR6Q01684 191 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NHP10Q03435 203 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YML108WQ03759 105 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W FIN1Q03898 291 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GPI11Q06636 219 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W HUA2Q12134 243 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MNL2Q12205 849 aa10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ARG3P05150 338 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W MIS1P09440 975 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W NFT1P0CE68 1218 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GLN3P18494 730 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data10.2□□□□□ -0.78not detected
PRP4YPR178W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SGF29P25554 259 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CIN8P27895 1000 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W RPT1P33299 467 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YLF2P38746 405 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SFB3P38810 929 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GDH3P39708 457 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YER186CP40101 306 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SER33P40510 469 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W IRC6P43615 237 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W UPF3P48412 387 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COG5P53951 403 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W SIW14P53965 281 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YPL107WQ02873 248 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YML131WQ03102 365 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W TRS31Q03337 283 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W YDR109CQ04585 715 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W COA4Q05809 96 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GRX8Q05926 109 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W CRN1Q06440 651 aa10.2□□□□□ -0.78
PRP4YPR178W GPM2Q12008 311 aa10.2□□□□□ -0.78
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