RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	VMA16	P23968	213 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	MCM10	P32354	571 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YPK3	P38070	525 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	EFM2	P38347	419 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	HXT9	P40885	567 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	DIA3	P52290	468 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ZDS2	P54786	942 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YOL159C	Q08300	171 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	TCO89	Q08921	799 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	NKP1	Q12493	238 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.03	□□□□□ -1.92
YLR224W	YLR224W	ADH7	P25377	361 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PDR3	P33200	976 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	AGP2	P38090	596 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MET30	P39014	640 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	BUR6	P40096	142 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YSA1	Q01976	231 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RAD30	Q04049	632 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YMR254C	Q04838	102 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RSF1	Q05043	376 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	GRS2	Q06817	618 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PGS1	P25578	521 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	DBP8	P38719	431 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RTS1	P38903	757 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PHO90	P39535	881 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ELO1	P39540	310 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RTS2	P40962	232 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SGM1	P47166	707 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	EKI1	Q03764	534 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	FMP42	Q04991	504 aa		3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	CDC16	P09798	840 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	GID7	P25569	745 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MGR1	P25573	417 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	CHS3	P29465	1165 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PAH1	P32567	862 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RAD24	P32641	659 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YBL029W	P38201	376 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	TSC10	P38342	320 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	VID27	P40157	782 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RGI2	P40188	164 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YIL060W	P40519	144 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SAD1	P43589	448 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YLR352W	Q06479	807 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RDR1	Q08904	546 aa		3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ARG81	P05085	880 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PUT2	P07275	575 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MAL33	P38157	468 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	UBA4	P38820	440 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	BZZ1	P38822	633 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YEL068C	P39977	110 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	LYS14	P40971	790 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	FET5	P43561	622 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	PKP2	P53170	491 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	NUP100	Q02629	959 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YKU80	Q04437	629 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RTT109	Q07794	436 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	NRT1	Q08485	598 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	TAH18	Q12181	623 aa		2.99	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	KAR3	P17119	729 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	HNM1	P19807	563 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ARP1	P38696	384 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ANS1	P38832	159 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YND1	P40009	630 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YAT2	P40017	923 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	FAR3	P46671	204 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YGR127W	P53275	312 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SOL4	P53315	255 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YML037C	Q03703	340 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	GRC3	Q07845	632 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	HUA2	Q12134	243 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.98	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	SEM1	O94742	89 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	YIH1	P25637	258 aa		2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
YLR224W	YLR224W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22.4 ms