RNA–Protein interactions for RNA: YHR119W

SET1, Transcript of Histone methyltransferase, subunit of the COMPASS (Set1C) complex, yeast

Gene SET1, Length 3,243 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SET1	YHR119W	TWF1	P53250	332 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MRS2	Q01926	470 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DFG5	Q05031	458 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YEH2	Q07950	538 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	AI1	P03875	834 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HTA2	P04912	132 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CBP1	P07252	654 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ADH7	P25377	361 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YKL077W	P36081	392 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CAF4	P36130	643 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MRPL4	P36517	319 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.31	□□□□□ -1.88	not detected
SET1	YHR119W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RSM25	P40496	264 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PET130	P47065	347 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YGL185C	P53100	379 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	WAR1	Q03631	944 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DCR2	Q05924	578 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NRT1	Q08485	598 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SRO7	Q12038	1033 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ISN1	Q99312	450 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SPR1	P32603	445 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GPB2	P39717	880 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SLZ1	P40167	298 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CIN5	P40917	295 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	IRC5	P43610	853 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	STB2	P46679	850 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GLG2	P47011	380 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	APS3	P47064	194 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	COX16	P47081	118 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	COG1	P53079	417 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YGR066C	P53242	292 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	INA17	Q02888	182 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ISU1	Q03020	165 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ENV7	Q12003	364 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GPR1	Q12361	961 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.3	□□□□□ -1.88	not detected
SET1	YHR119W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	COQ1	P18900	473 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ZIP1	P31111	875 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YKL063C	P35725	167 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RCY1	P39531	840 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MET28	P40573	187 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	FMS1	P50264	508 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	IPI3	P53877	555 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SRL4	Q03085	281 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SPC24	Q04477	213 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SOV1	Q04748	898 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RCO1	Q04779	684 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	BSC6	Q08280	497 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	GNT1	Q12096	491 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PRR1	P28708	518 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ATP7	P30902	174 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NDI1	P32340	513 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CST26	P38226	397 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PFF1	P38244	976 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RTT107	P38850	1070 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ZRG8	P40021	1076 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	NDC80	P40460	691 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YAP5	P40574	245 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SHR5	P41912	237 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RRN9	P53437	365 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	RSM24	Q03976	319 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CRR1	Q05790	422 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	CDD1	Q06549	142 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	YCL068C	P25593	260 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	PPA2	P28239	310 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	SIN4	P32259	974 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SET1	YHR119W	APT2	P36973	181 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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