RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DNF2	YDR093W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BUD7	Q08754	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RRD2	Q12461	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RAM1	P22007	431 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	PPH22	P23595	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YHL026C	P38740	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ACO2	P39533	789 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YJL107C	P42947	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPT20	P50875	604 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CIA1	Q05583	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TRE1	Q08919	783 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SFM1	Q12314	213 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TIM9	O74700	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	COX3	P00420	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TMN3	P40071	706 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ALG8	P40351	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FAR7	P43592	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	EFM3	P47163	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NMA2	P53204	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KIN4	Q01919	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YET2	Q04210	160 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	GPN3	Q06543	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MUM3	Q08750	479 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HOP1	P20050	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KAP122	P32767	1081 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SPT23	P35210	1082 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MGE1	P38523	228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MTW1	P39731	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TWF1	P53250	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNF12	P53628	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RSA1	Q08932	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SUT2	Q12286	268 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	UGA4	P32837	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YBR063C	P38083	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
DNF2	YDR093W	SDS3	P40505	327 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YIL001W	P40560	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MTC3	P53077	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SNX41	Q04053	625 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YBR056W	P38081	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YSW1	P38280	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YHL012W	P38709	493 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RCY1	P39531	840 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CGR1	P53188	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	COG7	P53195	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KTR6	P54070	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	IRC15	Q02733	499 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	ATP25	Q03153	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RSC2	Q06488	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
DNF2	YDR093W	UAF30	Q08747	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	NUS1	Q12063	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HTA2	P04912	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CCA1	P21269	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MTC2	P34246	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MCM7	P38132	845 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CCZ1	P38273	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	DUN1	P39009	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FAU1	P40099	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	TIR3	P40552	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	CIN1	P40987	1014 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MPS3	P47069	682 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
DNF2	YDR093W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	COQ9	Q05779	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	BLS1	Q06071	122 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	YLR012C	Q07927	99 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	FEX2	Q08991	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
DNF2	YDR093W	SKS1	Q12505	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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