RNA–Protein interactions for RNA: YBR267W

REI1, Transcript of Cytoplasmic pre-60S factor, yeast

Gene REI1, Length 1,182 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REI1	YBR267W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SLY1	P22213	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	MRPL8	P22353	238 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ARG1	P22768	420 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SNT1	P25357	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	MEI4	P29467	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	CCT6	P39079	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ELO1	P39540	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ERP2	P39704	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	FLC2	P39719	783 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SAW1	P39735	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	GIP2	P40036	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ARG2	P40360	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YIL054W	P40524	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	TDA10	P42938	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	HLJ1	P48353	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	AMA1	P50082	593 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YGR266W	P53326	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YML096W	Q04489	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	VHS3	Q08438	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.54	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	INH1	P01097	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	PMR1	P13586	950 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	KAR4	P25583	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	ADY2	P25613	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
REI1	YBR267W	ALG14	P38242	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SMF2	P38778	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SPC97	P38863	823 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	STN1	P38960	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	CNN1	P43618	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SIP4	P46954	829 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	GNP1	P48813	663 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	MNT2	P53059	558 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	TYW3	P53177	273 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RTS3	P53289	263 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YML119W	Q03208	357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RKM2	Q03942	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	YIG1	Q08956	461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	GNT1	Q12096	491 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	SUL2	Q12325	893 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	GPM3	Q12326	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
REI1	YBR267W	RIP1	P08067	215 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	ABF1	P14164	731 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	PMA2	P19657	947 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	DAL82	P21705	255 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YCR015C	P25616	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	LYP1	P32487	611 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	PPG1	P32838	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YKL069W	P36088	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YBR032W	P38223	100 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TED1	P40533	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	SLS1	P42900	643 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YFR018C	P43599	363 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	SAE2	P46946	345 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TIM54	P47045	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	SPC105	P53148	917 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	SNO2	P53823	222 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	YNL143C	P53908	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TEP1	P53916	434 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	UBX4	P54730	416 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	RSM10	Q03201	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	SHE9	Q04172	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
REI1	YBR267W	TPO1	Q07824	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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