RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		19.53	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	MMP19	Q99542	508 aa		19.53	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		19.53	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXC6	P09630	235 aa		19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT23	Q9C075	422 aa		19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	NBPF3	Q9H094	633 aa		19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	19.52	■□□□□ 0.72
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	19.52	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	KDM4A	O75164	1064 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRDN	Q13061	729 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCTD1	Q719H9	257 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	REPS2	Q8NFH8	660 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCAF4	Q8WV16	495 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	RLF	Q13129	1914 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	NEDD4	P46934	1319 aa		19.51	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035		B4E1Z4	1266 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	NOV	P48745	357 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX11	Q96FC9	970 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL25	Q9H293	177 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLXNB2	O15031	1838 aa		19.5	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP2A1	O14983	1001 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	SGSM2	O43147	1006 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLA2G6	O60733	806 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNGA1	P29973	690 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	OAZ1	P54368	228 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	DGKH	Q86XP1	1220 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	SHISA4	Q96DD7	197 aa		19.49	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0G2JMZ2	1700 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	COBL	O75128	1261 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	KAT14	Q9H8E8	782 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO40	Q9UH90	709 aa		19.48	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP2C19	P33261	490 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTH1R	Q03431	593 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHST13	Q8NET6	341 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIPK3	Q9Y572	518 aa		19.47	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP14	Q460N5	1801 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	PGK2	P07205	417 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	CASC1	Q6TDU7	716 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	DPF3	Q92784	378 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAML3	Q96JK9	1138 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	HTT	P42858	3142 aa		19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	19.46	■□□□□ 0.71
JMJD1C-211	ENST00000633035	MSC	O60682	206 aa		19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDHB	P11177	359 aa		19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC174	Q6PII3	467 aa		19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		19.45	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALAS1	P13196	640 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC16A2	P36021	539 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TKFC	Q3LXA3	575 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PNMA1	Q8ND90	353 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP4K1	Q92918	833 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TNKS	O95271	1327 aa		19.44	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERICH2	A1L162	156 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	CYP21A2	P08686	494 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SNAP25	P60880	206 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	SKAP1	Q86WV1	359 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCOA7	Q8NI08	942 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		19.43	■□□□□ 0.7
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		19.43	■□□□□ 0.7

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