RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.99■■□□□ 1.27
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SGMS1-208ENST00000608287 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 AAK1Q2M2I8 961 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 SH2D4AQ9H788 454 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 MSRAQ9UJ68 235 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.98■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SGMS1-208ENST00000608287 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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SGMS1-208ENST00000608287 MFSD5Q6N075 450 aa22.97■■□□□ 1.27
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SGMS1-208ENST00000608287 USP17L21D6R901 530 aa22.91■■□□□ 1.26
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SGMS1-208ENST00000608287 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.88■■□□□ 1.25
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SGMS1-208ENST00000608287 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 SMIM22K7EJ46 135 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 APPP05067 770 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.87■■□□□ 1.25
SGMS1-208ENST00000608287 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.87■■□□□ 1.25
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