RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 MFSD5Q6N075 450 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 ELP1O95163 1332 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 USP17L12C9JPN9 530 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 USP17L21D6R901 530 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 TNFRSF10AO00220 468 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 KCNA10Q16322 511 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC174Q6PII3 467 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-230ENST00000600058 MCM3APO60318 1980 aa20.33■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 RAD21O60216 631 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CDK7P50613 346 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM240Q5SV17 173 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 RASIP1Q5U651 963 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DDX11Q96FC9 970 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.847e-7■■■□□ 17.5
FCHO1-230ENST00000600058 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 MYADML2A6NDP7 307 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PBX4Q9BYU1 374 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 APBB1O00213 710 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 COL9A1P20849 921 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PBX2P40425 430 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 RIPK3Q9Y572 518 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ATP2A1O14983 1001 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ASGR1P07306 291 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CSF2RAP15509 400 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ACVR2BQ13705 512 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 UBE3CQ15386 1083 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CTR9Q6PD62 1173 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 TMEM199Q8N511 208 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SPC25Q9HBM1 224 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 MYH4Q9Y623 1939 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GBF1Q92538 1859 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ARVCFO00192 962 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ADCY6O43306 1168 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ATP5JP18859 108 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 GJA9P57773 515 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 PPM1EQ8WY54 764 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 THEGQ9P2T0 379 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-230ENST00000600058 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 F5H6K3 240 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CHGBP05060 677 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 KLRC3Q07444 240 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF365Q70YC5 407 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 FAM126BQ8IXS8 530 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 PANK1Q8TE04 598 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 HAUS7Q99871 368 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 NYAP2Q9P242 653 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 TLR3O15455 904 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ZBED4O75132 1171 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 HMMRO75330 724 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 NDUFB10O96000 172 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ACRP10323 421 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 GNASQ5JWF2 1037 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 CPXCR1Q8N123 301 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 FGD4Q96M96 766 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 ASB2Q96Q27 587 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-230ENST00000600058 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.25■□□□□ 0.83
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