RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 FAM129CQ86XR2 697 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SYT8Q8NBV8 401 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MZB1Q8WU39 189 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 DRC1Q96MC2 740 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MTA3Q9BTC8 594 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 BDH2Q9BUT1 245 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM7Q9H2U9 754 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 FAM8A1Q9UBU6 413 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PALD1Q9ULE6 856 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PNLIPP16233 465 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 WDR78Q5VTH9 848 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 HHIPL2Q6UWX4 724 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RNF111Q6ZNA4 994 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 KRBA2Q6ZNG9 492 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TMEFF1Q8IYR6 380 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SPG7Q9UQ90 795 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CCER2I3L3R5 266 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SUV39H1O43463 412 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 LRRN2O75325 713 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CDR1P51861 262 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 YARSP54577 528 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CAP1Q01518 475 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM62Q0P6H9 643 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC96Q2M329 555 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PWWP2AQ96N64 755 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ASPNQ9BXN1 380 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf49Q9H741 205 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 K7ESM1 405 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 GOLIM4O00461 696 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 MPOP05164 745 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 USP17L7P0C7H9 530 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ERVFRD-1P60508 538 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SEPT6Q14141 434 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 RTP5Q14D33 572 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 LDHDQ86WU2 507 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CRELD1Q96HD1 420 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 MAP6Q96JE9 813 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SOWAHDA6NJG2 315 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC5O00471 708 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CREB3O43889 395 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SH3BP5O60239 455 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 RAB11FIP3O75154 756 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PPFIA4O75335 1185 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PEX14O75381 377 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 USP2O75604 605 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 EFEMP2O95967 443 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 RPL10P27635 214 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 KCNC1P48547 511 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 KCNA1Q09470 495 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF827Q17R98 1081 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC181Q5TID7 509 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 AGMOQ6ZNB7 445 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CEP128Q6ZU80 1094 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 NLGN1Q8N2Q7 840 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD6Q96NE9 622 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 NUB1Q9Y5A7 615 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 SHISA3A0PJX4 238 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ARL4AP40617 200 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 MAPK8P45983 427 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 TNNI2P48788 182 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ZXDAP98168 799 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 ATP2B2Q01814 1243 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms