RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575701.4

SRRM2-223, Transcript of serine/arginine repetitive matrix 2, human

TSL 3

Gene SRRM2, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM2-223	ENST00000575701	STAT3	P40763	770 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		29.77	■■■□□ 2.36
SRRM2-223	ENST00000575701	CENPF	P49454	3210 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	CDC45	O75419	566 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	OAZ1	P54368	228 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	MTFR1	Q15390	333 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	POTEF	A5A3E0	1075 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	HOXC6	P09630	235 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	CCL5	P13501	91 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	TRIB2	Q92519	343 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ANKS1A	Q92625	1134 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	CCDC96	Q2M329	555 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	FCER1A	P12319	257 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	KCTD1	Q719H9	257 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	RNF208	Q9H0X6	261 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	TNKS	O95271	1327 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	GJB1	P08034	283 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	CAPN2	P17655	700 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ADORA2A	P29274	412 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.72	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	PDHB	P11177	359 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	DPP9	Q86TI2	863 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	NCOA7	Q8NI08	942 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701		E7EWF7	191 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	SNHG28	P0DPA3	235 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	KCTD2	Q14681	263 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	CPXCR1	Q8N123	301 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	MMP19	Q99542	508 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SRRM2-223	ENST00000575701	RPTOR	Q8N122	1335 aa		29.7	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	FBXO40	Q9UH90	709 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		29.69	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	GJA8	P48165	433 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	CCL14	Q16627	93 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	CHST13	Q8NET6	341 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	29.67	■■■□□ 2.34	2e-9	■■■■■ 36.3
SRRM2-223	ENST00000575701	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	29.66	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	ERICH2	A1L162	156 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	TRIM32	Q13049	653 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	NECTIN1	Q15223	517 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	SEC23A	Q15436	765 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	TKFC	Q3LXA3	575 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	RNF20	Q5VTR2	975 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	RIPK3	Q9Y572	518 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	COBL	O75128	1261 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	SGPL1	O95470	568 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	PNMA2	Q9UL42	364 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNF536	O15090	1300 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SRRM2-223	ENST00000575701	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
SRRM2-223	ENST00000575701	SLC27A2	O14975	620 aa		29.63	■■■□□ 2.33
SRRM2-223	ENST00000575701	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	29.63	■■■□□ 2.33
SRRM2-223	ENST00000575701	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		29.63	■■■□□ 2.33

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