RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 TFAP4Q01664 338 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE4BQ07343 736 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX11Q96FC9 970 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 LNPKQ9C0E8 428 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 INCENPQ9NQS7 918 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOMM22Q9NS69 142 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTMR4Q9NYA4 1195 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIPK3Q9Y572 518 aa8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PPC1 479 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPY2A6NKD2 308 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM232C9JQI7 657 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZBED4O75132 1171 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTLL1O95922 423 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGK1P00558 417 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMP3P12645 472 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADCYAP1R1P41586 468 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDE1AP54750 535 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNAP25P60880 206 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM60Q495X7 471 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLFN13Q68D06 897 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM227BQ96M60 508 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TINF2Q9BSI4 451 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 STX8Q9UNK0 236 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCCP23508 829 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 COPB2P35606 906 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 HAND2P61296 217 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC41Q15345 812 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC96Q2M329 555 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC174Q6PII3 467 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD1Q719H9 257 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 Q7L0L9 218 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TDHQ8IZJ6 230 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD35Q8N283 1001 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RILPL2Q969X0 211 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 EVI5LQ96CN4 794 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FEM1BQ9UK73 627 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LTBP2Q14767 1821 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RARBP10826 455 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 AKR1A1P14550 325 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMP8BP34820 402 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC1A4P43007 532 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAT2P52630 851 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 EXOC6Q8TAG9 804 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RNF146Q9NTX7 359 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCM3APO60318 1980 aa8.5□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADCY6O43306 1168 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALAS1P13196 640 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTN2Q02246 1040 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLE2Q04725 743 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB123Q8N688 67 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MKL1Q969V6 931 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17RBQ9NRM6 502 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 HELLSQ9NRZ9 838 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.49□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQY0 241 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYADML2A6NDP7 307 aa8.48□□□□□ -1.05
CCNDBP1-212ENST00000567690 POTEB2H3BUK9 544 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms