RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 AOC3Q16853 763 aa23.02■■□□□ 1.28
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CCNDBP1-205ENST00000564630 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.28
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CCNDBP1-205ENST00000564630 USP17L21D6R901 530 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP15O95972 392 aa23.01■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.01■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX58Q96C10 678 aa23.01■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 MED15Q96RN5 788 aa23.01■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A087X0B3 334 aa23■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PSD3Q9NYI0 1048 aa23■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PPIP5K2O43314 1243 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLRK1P26718 216 aa22.99■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NPY5RQ15761 445 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMBP2O15034 1052 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 RABGGTAQ92696 567 aa22.99■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 WNT7AO00755 349 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.98■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 CARD6Q9BX69 1037 aa22.98■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 MRFAP1Q9Y605 127 aa22.97■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF174Q15697 407 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TC2NQ8N9U0 490 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.96■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NMT2O60551 498 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPS2Q13227 327 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 NR1I3Q14994 352 aa22.96■■□□□ 1.27
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
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CCNDBP1-205ENST00000564630 DPYDQ12882 1025 aa22.95■■□□□ 1.26
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.95■■□□□ 1.26
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CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A1B0GTH6 734 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP2B4P23634 1241 aa22.94■■□□□ 1.26
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PTGDRQ13258 359 aa22.94■■□□□ 1.26
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CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA1Q5VX52 437 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 GSDMAQ96QA5 445 aa22.94■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCG2P13521 617 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDX5P30044 214 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 TUBB4BP68371 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 DOK7Q18PE1 504 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 JDP2Q8WYK2 163 aa22.93■■□□□ 1.26
CCNDBP1-205ENST00000564630 EXOC4Q96A65 974 aa22.93■■□□□ 1.26
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