RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563386.5

USP10-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-208ENST00000563386 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 REPS2Q8NFH8 660 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 KRT23Q9C075 422 aa22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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USP10-208ENST00000563386 FCER1AP12319 257 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 NOVP48745 357 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 IQCA1Q86XH1 822 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 DEFB118Q96PH6 123 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.25■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 SNAP25P60880 206 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 FAM160B2Q86V87 743 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 DCAF4Q8WV16 495 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 TTC14Q96N46 770 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 MMP19Q99542 508 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.156e-7■■■□□ 16.3
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USP10-208ENST00000563386 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 ZSWIM5Q9P217 1185 aa22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CYP21A2P08686 494 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 KCTD2Q14681 263 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.23■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 COBLO75128 1261 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 COPB2P35606 906 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 SLC16A2P36021 539 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 GJA8P48165 433 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 TRDNQ13061 729 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.22■■□□□ 1.15
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USP10-208ENST00000563386 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 KAT14Q9H8E8 782 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 SLC5A4Q9NY91 659 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 RIPK3Q9Y572 518 aa22.22■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
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USP10-208ENST00000563386 HOXC6P09630 235 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CCDC174Q6PII3 467 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 DGKHQ86XP1 1220 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 MAP4K1Q92918 833 aa22.21■■□□□ 1.15
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USP10-208ENST00000563386 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.21■■□□□ 1.15
USP10-208ENST00000563386 CYP2C19P33261 490 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 NT5C2P49902 561 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CASC1Q6TDU7 716 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 PRR12Q9ULL5 1215 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 TNKSO95271 1327 aa22.2■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 E7EWF7 191 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ATP2A1O14983 1001 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 PLA2G6O60733 806 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 FDX1P10109 184 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 PDHBP11177 359 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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USP10-208ENST00000563386 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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USP10-208ENST00000563386 DDX11Q96FC9 970 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.19■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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USP10-208ENST00000563386 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.18■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CNGA1P29973 690 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP10-208ENST00000563386 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.18■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ALAS1P13196 640 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ZNF543Q08ER8 600 aa22.17■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 CHST3Q7LGC8 479 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 NCOA7Q8NI08 942 aa22.16■■□□□ 1.14
USP10-208ENST00000563386 ANKS1AQ92625 1134 aa22.16■■□□□ 1.14
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