RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561280.5

CHP1-209, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 4

Gene CHP1, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-209	ENST00000561280	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	MIER1	Q8N108	512 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.98	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280		F5H6K3	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	APP	P05067	770 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	FOSL2	P15408	326 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	KLRC3	Q07444	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	GNAT2	P19087	354 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	TDO2	P48775	406 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ACLY	P53396	1101 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	KCNA10	Q16322	511 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	MYLIP	Q8WY64	445 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
CHP1-209	ENST00000561280	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	NDUFB10	O96000	172 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	RASA1	P20936	1047 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.95	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ELP1	O95163	1332 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TTLL1	O95922	423 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TIMP1	P01033	207 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	CHGB	P05060	677 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	FDX1	P10109	184 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ACVR2B	Q13705	512 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	APPBP2	Q92624	585 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.94	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ITGB8	P26012	769 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	OAZ1	P54368	228 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	PDE4B	Q07343	736 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.93	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	GPAA1	O43292	621 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	ASGR1	P07306	291 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	DNAJB2	P25686	324 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CHP1-209	ENST00000561280	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18

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