RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCTD1Q719H9 257 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CPXCR1Q8N123 301 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 REPS2Q8NFH8 660 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCAF4Q8WV16 495 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLA2G6O60733 806 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOXC6P09630 235 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADORA2AP29274 412 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GJA8P48165 433 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC4A3P48751 1232 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM32Q13049 653 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRDNQ13061 729 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCL14Q16627 93 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CASC1Q6TDU7 716 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DGKHQ86XP1 1220 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MMP19Q99542 508 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPTORQ8N122 1335 aa14.57□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP2A1O14983 1001 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 OAZ1P54368 228 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCTD2Q14681 263 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP4K1Q92918 833 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DEFB118Q96PH6 123 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MGAMO43451 1857 aa14.56□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 COBLO75128 1261 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SGPL1O95470 568 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP21A2P08686 494 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CAPN2P17655 700 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KAT14Q9H8E8 782 aa14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PDHBP11177 359 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKS1AQ92625 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FBXO40Q9UH90 709 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RIPK3Q9Y572 518 aa14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNKSO95271 1327 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CDC45O75419 566 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SLC16A2P36021 539 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF543Q08ER8 600 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC174Q6PII3 467 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNMA1Q8ND90 353 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHST13Q8NET6 341 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 NCOA7Q8NI08 942 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SHISA4Q96DD7 197 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DDX11Q96FC9 970 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.53□□□□□ -0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 E7EWF7 191 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PGK2P07205 417 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNHG28P0DPA3 235 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYP2C19P33261 490 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNAP25P60880 206 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TKFCQ3LXA3 575 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RLFQ13129 1914 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CENPFP49454 3210 aa14.52□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ERICH2A1L162 156 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNGA1P29973 690 aa14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms