RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TXLNAP40222 546 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NFE2L2Q16236 605 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TMC4Q7Z404 712 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ARMC5Q96C12 935 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GMLQ99445 158 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MYD88Q99836 296 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PTPN18Q99952 460 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RUBCNLQ9H714 662 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.23□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CDC14CA4D256 554 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SNAP23O00161 211 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EFHC2Q5JST6 749 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GIPC2Q8TF65 315 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OPTNQ96CV9 577 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SHISA4Q96DD7 197 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GMCL1Q96IK5 515 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 H3BM21 787 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KIF4AO95239 1232 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OCLNQ16625 522 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCL15Q16663 113 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DACT2Q5SW24 774 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SDE2Q6IQ49 451 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SV2AQ7L0J3 742 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 VWA5B2Q8N398 1253 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MKL1Q969V6 931 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EVI5LQ96CN4 794 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 STAP2Q9UGK3 403 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 XDHP47989 1333 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ERBB4Q15303 1308 aa8.21□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MMP14P50281 582 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RIPK4P57078 832 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DLGAP5Q15398 846 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PODNQ7Z5L7 613 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GPATCH3Q96I76 525 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM161BQ96MY7 647 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 A0A1W2PNR3 127 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SYN1P17600 705 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ATP4AP20648 1035 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KCNJ4P48050 445 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BIRC2Q13490 618 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LBRQ14739 615 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DBN1Q16643 649 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CFAP100Q494V2 611 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLBD2Q8NHP8 589 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CPA4Q9UI42 421 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.18□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLIN1O60240 522 aa8.18□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms