RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 EFCAB8A8MWE9 144 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ATP8B1O43520 1251 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NMT2O60551 498 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TSPY3P0CV98 308 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TSPY8P0CW00 308 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 IL1R1P14778 569 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CASQ1P31415 396 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPP1R2P41236 205 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOVP48745 357 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K9P80192 1104 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRIM14Q14142 442 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 IL17AQ16552 155 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RRAGBQ5VZM2 374 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMC4Q7Z404 712 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMTC1Q8IUR5 882 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNGA4Q8IV77 575 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 AK8Q96MA6 479 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 BARHL2Q9NY43 387 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 DNAI1Q9UI46 699 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAD2L2Q9UI95 211 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH6P13533 1939 aa8.7□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 COL4A1P02462 1669 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A1B0GUL6 1792 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC175P0C221 793 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNA11P29992 359 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MCM7P33993 719 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 UBA7P41226 1012 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADKP55263 362 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBL2Q08999 1139 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NFIXQ14938 502 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF827Q17R98 1081 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 UBXN4Q92575 508 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM47Q9BQJ4 181 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 C6orf50Q9HD87 102 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CD209Q9NNX6 404 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 SCN7AQ01118 1682 aa8.69□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 WNT7AO00755 349 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 N4BP3O15049 544 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NPHP1O15259 732 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TEX33O43247 280 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASA1P20936 1047 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 STAT6P42226 847 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDK8P49336 464 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNQ4P56696 695 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNG11P61952 73 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CBX1P83916 185 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 AMPD3Q01432 767 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 PAK1Q13153 545 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 STIM1Q13586 685 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRY2Q49AN0 593 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCP11X2Q5H9J9 407 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASGRP2Q7LDG7 609 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADSSL1Q8N142 457 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CNBD1Q8NA66 436 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MNS1Q8NEH6 495 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 MTRQ99707 1265 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 THAP9Q9H5L6 903 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 COL24A1Q17RW2 1714 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.68□□□□□ -1.02
UBE2CP1-201ENST00000557130 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms