RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX1-202ENST00000555574 PHF24Q9UPV7 400 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX1-202ENST00000555574 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX1-202ENST00000555574 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX1-202ENST00000555574 RIPK3Q9Y572 518 aa20.27■□□□□ 0.84
TMX1-202ENST00000555574 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SLC4A3P48751 1232 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 CPXCR1Q8N123 301 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 KIFC2Q96AC6 838 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.26■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ERC2O15083 957 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 AKR1A1P14550 325 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 C1orf53Q5VUE5 145 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 RNF180Q86T96 592 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 DDX11Q96FC9 970 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 FSD1Q9BTV5 496 aa20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ATP2A1O14983 1001 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ZBED4O75132 1171 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TTLL1O95922 423 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 BADQ92934 168 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 MKL1Q969V6 931 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.24■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 A0A1W2PQY0 241 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TSPY3P0CV98 308 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TSPY8P0CW00 308 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 TLE2Q04725 743 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SHHQ15465 462 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 NAPBQ9H115 298 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 FEM1BQ9UK73 627 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 A0A0C4DFX4 3053 aa20.23■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 POTEB2H3BUK9 544 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ADAMTS4O75173 837 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 PDE4BQ07343 736 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 PPARAQ07869 468 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 DLL1O00548 723 aa20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 MX1P20591 662 aa20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 SLFN13Q68D06 897 aa20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 FAM161BQ96MY7 647 aa20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 GUCD1Q96NT3 240 aa20.21■□□□□ 0.83
TMX1-202ENST00000555574 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CLTBP09497 229 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 BMP3P12645 472 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ITGB8P26012 769 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 TFAP4Q01664 338 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 FGD4Q96M96 766 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 FBXO40Q9UH90 709 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.2■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 MYADML2A6NDP7 307 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 TMEM232C9JQI7 657 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 FOXP2O15409 715 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ACLYP53396 1101 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 OAZ1P54368 228 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CHST13Q8NET6 341 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 SALL3Q9BXA9 1300 aa20.19■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 CDH23Q9H251 3354 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ADCY6O43306 1168 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 STAT2P52630 851 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 ZNF697Q5TEC3 545 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 EYSQ5T1H1 3165 aa20.18■□□□□ 0.82
TMX1-202ENST00000555574 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms