RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533054.5

ROBO4-208, Transcript of roundabout guidance receptor 4, human

TSL 2 BASIC

Gene ROBO4, Length 3,071 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.91	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	MYO1B	O43795	1136 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	E2F4	Q16254	413 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CYTH3	O43739	400 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	GH2	P01242	217 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
ROBO4-208	ENST00000533054	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TRIM66	O15016	1216 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ADAMTS3	O15072	1205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TTLL1	O95922	423 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	RCAN1	P53805	252 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	GRM4	Q14833	912 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	COL4A5	P29400	1685 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	KRT2	P35908	639 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PIGS	Q96S52	555 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	GML	Q99445	158 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MYH1	P12882	1939 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		13.89	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ELP1	O95163	1332 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054		A0A087WWV3	80 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	WNT10B	O00744	389 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	GNAQ	P50148	359 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF174	Q15697	407 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PDHB	P11177	359 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SNAP25	P60880	206 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ICA1	Q05084	483 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TNIP1	Q15025	636 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PRELP	P51888	382 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	NAPA	P54920	295 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	ZNF445	P59923	1031 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	JAG1	P78504	1218 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	COA7	Q96BR5	231 aa		13.87	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	SLC1A4	P43007	532 aa		13.86	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
ROBO4-208	ENST00000533054	PDILT	Q8N807	584 aa		13.86	□□□□□ -0.19

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