RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527446.5

RPS3-209, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS3, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-209ENST00000527446 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.86□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.86□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CYTH3O43739 400 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 SMARCA1P28370 1054 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 DSG3P32926 999 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 KIF5BP33176 963 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 MCM2P49736 904 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 STK3Q13188 491 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 FAM160B2Q86V87 743 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 NECAB1Q8N987 351 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 TMX3Q96JJ7 454 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 MYPNQ86TC9 1320 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 FLOT1O75955 427 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CTDNEP1O95476 244 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CYP2C8P10632 490 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 GNAQP50148 359 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 STAT2P52630 851 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.032e-37■■■□□ 18
RPS3-209ENST00000527446 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 LBX2Q6XYB7 198 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 REPS2Q8NFH8 660 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 GTF3C6Q969F1 213 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 MTMR8Q96EF0 704 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 LZTS2Q9BRK4 669 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 SPZ1Q9BXG8 430 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 PCNTO95613 3336 aa14.84□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.83□□□□□ -0.03
RPS3-209ENST00000527446 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 VWA5AO00534 786 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 OSBPP22059 807 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 HERVK_113P62684 666 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ATG4CQ96DT6 458 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.83□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CNMDO75829 334 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 IFNAR1P17181 557 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 KIFC2Q96AC6 838 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 RBPJLQ9UBG7 517 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PNMA3Q9UL41 463 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.82□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PEX10O60683 326 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 SNAP25P60880 206 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CUL4AQ13619 759 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 BTBD7Q9P203 1132 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ZNF536O15090 1300 aa14.81□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CA12O43570 354 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 DTNBO60941 627 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ALDH1A1P00352 501 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CRHR2Q13324 411 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 RNF186Q9NXI6 227 aa14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 ATP2A1O14983 1001 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 TLR2O60603 784 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PPFIA3O75145 1194 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 FDX1P10109 184 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 BCRP11274 1271 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 PKN1Q16512 942 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 Q3C1V9 767 aa14.79□□□□□ -0.04
RPS3-209ENST00000527446 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms