RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522962.5

STAU2-222, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene STAU2, Length 1,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-222	ENST00000522962	RAP1GAP	P47736	663 aa		7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	NUP160	Q12769	1436 aa		7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PAGE1	O75459	146 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LIG1	P18858	919 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PAX3	P23760	479 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	HOMER1	Q86YM7	354 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	C1QL4	Q86Z23	238 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RELT	Q969Z4	430 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	EVI5L	Q96CN4	794 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	NUDC	Q9Y266	331 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	USP31	Q70CQ4	1352 aa		7.3	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	TMPRSS2	O15393	492 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PLIN1	O60240	522 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	OXCT1	P55809	520 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RASA3	Q14644	834 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PDZD3	Q86UT5	571 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	IER2	Q9BTL4	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	KRT82	Q9NSB4	513 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		7.29	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	TSPAN15	O95858	294 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LMNB1	P20700	586 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	GYS2	P54840	703 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	RAB33A	Q14088	237 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LRRC14	Q15048	493 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		7.28	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		7.27	□□□□□ -1.24
STAU2-222	ENST00000522962	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	PRRG2	O14669	202 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	ZNF862	O60290	1169 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	CEACAM5	P06731	702 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	SLFN14	P0C7P3	912 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	PTMS	P20962	102 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	UBE4A	Q14139	1066 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	MLANA	Q16655	118 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	EID1	Q9Y6B2	187 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	KIF15	Q9NS87	1388 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	PLXNC1	O60486	1568 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	NCAN	O14594	1321 aa		7.27	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.26	□□□□□ -1.25
STAU2-222	ENST00000522962	LEFTY1	O75610	366 aa		7.26	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms