RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511481.5

SEC24D-211, Transcript of SEC24 homolog D, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24D, Length 2,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24D-211ENST00000511481 CNTD1Q8N815 330 aa6.5□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 GPT2Q8TD30 523 aa6.5□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 MTFR1LQ9H019 292 aa6.5□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.5□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 SYCE3A1L190 88 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 DCDC2BA2VCK2 349 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 J3QW42 95 aa6.49□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.376e-7■■■□□ 16.3
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SEC24D-211ENST00000511481 BMP2P12643 396 aa6.49□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.49□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 SETDB1Q15047 1291 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.48□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 TMPRSS15P98073 1019 aa6.48□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.48□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 TTC1Q99614 292 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.48□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 VSTM5A8MXK1 200 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 NAT2P11245 290 aa6.47□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 AP3B2Q13367 1082 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 ZNF460Q14592 562 aa6.47□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.47□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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SEC24D-211ENST00000511481 CUL7Q14999 1698 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 TTLL8A6PVC2 850 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 FBXO21O94952 628 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 APBA3O96018 575 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 BPIP17213 487 aa6.47□□□□□ -1.37
SEC24D-211ENST00000511481 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
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