RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 PORCNQ9H237 461 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLIP2Q9UDT6 1046 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.93□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 LAMA4Q16363 1823 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYP21A2P08686 494 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CNGA1P29973 690 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERVK-9P63128 1117 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERVK-24P63145 666 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 Q3C1V9 767 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLEKHH3Q7Z736 793 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP95Q96GE4 821 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 RBPJLQ9UBG7 517 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 STX8Q9UNK0 236 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.92□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEDD4P46934 1319 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 B4E1Z4 1266 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC27A2O14975 620 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 KDM4AO75164 1064 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 TTLL1O95922 423 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 FGRP09769 529 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 MFSD14CQ5VZR4 134 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CREB3L3Q68CJ9 461 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 IQCA1Q86XH1 822 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 GOPCQ9HD26 462 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 EMILIN3Q9NT22 766 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 MTMR4Q9NYA4 1195 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 FLRT1Q9NZU1 646 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 NYAP2Q9P242 653 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDH23Q9H251 3354 aa12.91□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A1W2PRG0 241 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 E7EWF7 191 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 TNFRSF10AO00220 468 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 DNM1LO00429 736 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 NMT2O60551 498 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 NT5C2P49902 561 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAP2K5Q13163 448 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 WDR78Q5VTH9 848 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 SIAH1Q8IUQ4 282 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPICE1Q8N0Z3 855 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCOA7Q8NI08 942 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 BADQ92934 168 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 UBAC1Q9BSL1 405 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMX2Q9Y320 296 aa12.9□□□□□ -0.34
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 MCCP23508 829 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 NECTIN1Q15223 517 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC178Q5BJE1 867 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP38Q8NB14 1042 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 LPAR1Q92633 364 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHMP4CQ96CF2 233 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 TANGO6Q9C0B7 1094 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 VCPKMTQ9H867 229 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZSWIM5Q9P217 1185 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 MTMR7Q9Y216 660 aa12.89□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERICH2A1L162 156 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L15C9J2P7 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L11C9JVI0 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L18D6R9N7 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L22D6RA61 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L19D6RCP7 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L20D6RJB6 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 MSCO60682 206 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 VCAM1P19320 739 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP17L24Q0WX57 530 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.88□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM265A0A087WTH1 108 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 F5H6K3 240 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 CYP2C19P33261 490 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 KLRC3Q07444 240 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 KRT32Q14532 448 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM60Q495X7 471 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRPV1Q8NER1 839 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 MKL1Q969V6 931 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 C12orf42Q96LP6 360 aa12.87□□□□□ -0.35
CD27-AS1-204ENST00000504270 PDLIM7Q9NR12 457 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms