RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 KCNMA1Q12791 1236 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CCNG2Q16589 344 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 HECTD3Q5T447 861 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SRLQ86TD4 932 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 NLRP3Q96P20 1036 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 VPS33BQ9H267 617 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.33□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 IL16Q14005 1332 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ZBTB39O15060 712 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 FOXO3O43524 673 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 AKR1B10O60218 316 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 TLR5O60602 858 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 B3GALNT1O75752 331 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 BBOX1O75936 387 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 INMTO95050 263 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 XBP1P17861 261 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GARTP22102 1010 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GTF2IP78347 998 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 LMNB2Q03252 620 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ADCY1Q08828 1119 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 FXNQ16595 210 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM67Q5HYA8 995 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 IRGCQ6NXR0 463 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RUFY3Q7L099 469 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 POF1BQ8WVV4 589 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 NEK1Q96PY6 1258 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CSRNP1Q96S65 589 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 LMAN2LQ9H0V9 348 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 FAM50BQ9Y247 325 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.32□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SLC35F4A4IF30 521 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 MAFKO60675 156 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RFPL3O75679 317 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 KRT13P13646 458 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GALNSP34059 522 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GRK6P43250 576 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RGS3P49796 1198 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GRM1Q13255 1194 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PPP2R5DQ14738 602 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 INF2Q27J81 1249 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GPR158Q5T848 1215 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RTL10Q7L3V2 364 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PHTF2Q8N3S3 785 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CENPOQ9BU64 300 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ST7Q9NRC1 585 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.31□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 TIPRLO75663 272 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 GFPT2O94808 682 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 HOXD10P28358 340 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 PDE6CP51160 858 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 28.1
PDCD4-211ENST00000498367 RETSATQ6NUM9 610 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 UROC1Q96N76 676 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 COPRSQ9NQ92 184 aa8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms