RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	EPHB3	P54753	998 aa		6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	NCAN	O14594	1321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268		B8ZZF3	427 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	CLEC3A	O75596	197 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	VIPR1	P32241	457 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	SLC9A7	Q96T83	725 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		6.66	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	ERCC3	P19447	782 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	MCM4	P33991	863 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	CTSW	P56202	376 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	RTP1	P59025	263 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	GIPC2	Q8TF65	315 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	CHST7	Q9NS84	486 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		6.65	□□□□□ -1.34
USP34-222	ENST00000498268	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	TRIM13	O60858	407 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	PNLIP	P16233	465 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	PI3	P19957	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	APOBR	Q0VD83	1088 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SLC6A18	Q96N87	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	KCNC2	Q96PR1	638 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.64	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	TNFRSF10C	O14798	259 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ACR	P10323	421 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ZNF385B	Q569K4	471 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	NKD1	Q969G9	470 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268		C9IYK1	514 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	VAV1	P15498	845 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	CCNF	P41002	786 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	CDR1	P51861	262 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ERVFRD-1	P60508	538 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	VMAC	Q2NL98	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		6.62	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SHOX	O15266	292 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ZNF205	O95201	554 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ZNF165	P49910	485 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	RTP2	Q5QGT7	225 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		6.61	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	HRK	O00198	91 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	N4BP3	O15049	544 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	PRKCA	P17252	672 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	BMP8B	P34820	402 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	JMJD8	Q96S16	334 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	IRAK3	Q9Y616	596 aa		6.6	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	NCKAP1L	P55160	1127 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	MZB1	Q8WU39	189 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	RELT	Q969Z4	430 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.59	□□□□□ -1.35
USP34-222	ENST00000498268	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		6.58	□□□□□ -1.36
USP34-222	ENST00000498268	SPON2	Q9BUD6	331 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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