RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-209	ENST00000491491	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	ACER1	Q8TDN7	264 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	DCAF4	Q8WV16	495 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	TMX2	Q9Y320	296 aa		27.59	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491		F5H6K3	240 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	SNHG28	P0DPA3	235 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	SYT1	P21579	422 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	KLRC3	Q07444	240 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	NBPF11	Q86T75	865 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	GOPC	Q9HD26	462 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	STK36	Q9NRP7	1315 aa		27.58	■■■□□ 2.01
MYCBP2-209	ENST00000491491	KLRF2	D3W0D1	207 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FKTN	O75072	461 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPP2	Q13103	211 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCDC96	Q2M329	555 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	WASF1	Q92558	559 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		27.57	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	STX6	O43752	255 aa		27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FUT2	Q10981	343 aa		27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	PDHX	O00330	501 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	DEXI	O95424	95 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	NDUFB10	O96000	172 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SLC1A4	P43007	532 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF543	Q08ER8	600 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	DGKZ	Q13574	1117 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FEZ1	Q99689	392 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SMARCA1	P28370	1054 aa		27.54	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		27.54	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	WDR18	Q9BV38	432 aa		27.54	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491		H3BQV1	296 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	PKP1	Q13835	747 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	IFFO2	Q5TF58	517 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	KCTD1	Q719H9	257 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ALG1	Q9BT22	464 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	VCPKMT	Q9H867	229 aa		27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	FOSB	P53539	338 aa		27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	C8orf76	Q96K31	380 aa		27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		27.52	■■■□□ 2
MYCBP2-209	ENST00000491491	USP17L10	C9JJH3	530 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	TLR2	O60603	784 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	BRD1	O95696	1058 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	BMP3	P12645	472 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	CAP1	Q01518	475 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		27.51	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	PTPRF	P10586	1907 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	USP14	P54578	494 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	HMGCS2	P54868	508 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	SP3	Q02447	781 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	CPVL	Q9H3G5	476 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	MTMR6	Q9Y217	621 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		27.5	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	CYTH3	O43739	400 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	CYP2C8	P10632	490 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	TRIM29	Q14134	588 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	AIFM3	Q96NN9	605 aa		27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.49	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	BACE1	P56817	501 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	MTMR2	Q13614	643 aa		27.48	■■□□□ 1.99
MYCBP2-209	ENST00000491491	PKN1	Q16512	942 aa		27.48	■■□□□ 1.99

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