RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.33□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 NMT2O60551 498 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 DEXIO95424 95 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TOP1P11387 765 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 RXRAP19793 462 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SHMT1P34896 483 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TNNI2P48788 182 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KRT85P78386 507 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TCP10Q12799 353 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 RESTQ13127 1097 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TNFAIP1Q13829 316 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GRM4Q14833 912 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MCTP1Q6DN14 999 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FAM83AQ86UY5 434 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FAM151AQ8WW52 585 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ALG1Q9BT22 464 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MYOZ2Q9NPC6 264 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.32□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MYH1P12882 1939 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TRAK2O60296 914 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TTLL1O95922 423 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MBD3O95983 291 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 XBP1P17861 261 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CACNB3P54284 484 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FUT2Q10981 343 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 BRAPQ7Z569 592 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CSRNP1Q96S65 589 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM47Q9BQJ4 181 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 STX8Q9UNK0 236 aa7.31□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CLRN2A0PK11 232 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 H7C1D1 291 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 DLL1O00548 723 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 AKR1B1P15121 316 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SMARCA1P28370 1054 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 VEGFBP49765 207 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ASPRV1Q53RT3 343 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TATDN1Q6P1N9 297 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 NBPF11Q86T75 865 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 FERMT3Q86UX7 667 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GPC2Q8N158 579 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PHKBQ93100 1093 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CEP95Q96GE4 821 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 SYT17Q9BSW7 474 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 VEZTQ9HBM0 779 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 NYAP2Q9P242 653 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CFAP45Q9UL16 551 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CNTNAP1P78357 1384 aa7.3□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ELP1O95163 1332 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF541Q9H0D2 1346 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 WNT10BO00744 389 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 DTNBO60941 627 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PLEKHA8P1O95397 391 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.29□□□□□ -1.24
MFSD1-217ENST00000489639 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms