RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485921.5

ABCF3-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, human

TSL 2

Gene ABCF3, Length 813 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCF3-216	ENST00000485921	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	ERO1A	Q96HE7	468 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		27.61	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	PARP14	Q460N5	1801 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	DDAH1	O94760	285 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	GRM4	Q14833	912 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921		Q3C1V9	767 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	MYL10	Q9BUA6	226 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	ZBED4	O75132	1171 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	KIF22	Q14807	665 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	FBXL16	Q8N461	479 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	BRF1	Q92994	677 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		27.58	■■■□□ 2.01
ABCF3-216	ENST00000485921	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CALM1	P0DP23	149 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CALM2	P0DP24	149 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CALM3	P0DP25	149 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	FDX1	P10109	184 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CCNA1	P78396	465 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	PLS1	Q14651	629 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	MAP3K14	Q99558	947 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CPVL	Q9H3G5	476 aa		27.57	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921		A0A0G2JMZ2	1700 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	KLRF2	D3W0D1	207 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	PSMC4	P43686	418 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CAP1	Q01518	475 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	APOBR	Q0VD83	1088 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	APOA5	Q6Q788	366 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RXRA	P19793	462 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CTGF	P29279	349 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	KIF5B	P33176	963 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	FCGRT	P55899	365 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	SNAP25	P60880	206 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	PORCN	Q9H237	461 aa		27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ZBTB43	O43298	467 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	STAT3	P40763	770 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ARHGEF6	Q15052	776 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	MICU3	Q86XE3	530 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CPXCR1	Q8N123	301 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	CCDC174	Q6PII3	467 aa		27.53	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		27.53	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	FANCB	Q8NB91	859 aa		27.53	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	EFCC1	Q9HA90	598 aa		27.53	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	MAPK4	P31152	587 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	OAZ1	P54368	228 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	KIF2C	Q99661	725 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
ABCF3-216	ENST00000485921	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	GNAQ	P50148	359 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	NEK4	P51957	841 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	TRIM17	Q9Y577	477 aa		27.51	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	ZNF536	O15090	1300 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	SLC25A27	O95847	323 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	GNRH1	P01148	92 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	ERCC3	P19447	782 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	SLC4A3	P48751	1232 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	RCAN1	P53805	252 aa		27.5	■■□□□ 1.99
ABCF3-216	ENST00000485921	EVC	P57679	992 aa		27.5	■■□□□ 1.99

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