RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TSPY4P0CV99 314 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TSPY10P0CW01 314 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 RAG1P15918 1043 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 LTKP29376 864 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 DAPK1P53355 1430 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ARSHQ5FYA8 562 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TTC6Q86TZ1 520 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRC-211ENST00000484135 GREM1O60565 184 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RAC2P15153 192 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 MCM4P33991 863 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CRKP46108 304 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 APOBRQ0VD83 1088 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SEZ6Q53EL9 994 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 FYB2Q5VWT5 728 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 UBP1Q9NZI7 540 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 GMIPQ9P107 970 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 TEX14Q8IWB6 1497 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NEO1Q92859 1461 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 GLI1P08151 1106 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 HK2P52789 917 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 EGR3Q06889 387 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 MLANAQ16655 118 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 GK5Q6ZS86 529 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP74Q9C0B2 1584 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SRFP11831 508 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF76P36508 570 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RNF4P78317 190 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 GAB4Q2WGN9 574 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NKD1Q969G9 470 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF5Q12774 1597 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RGS13O14921 159 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ATE1O95260 518 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF165P49910 485 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD4Q8TB40 342 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 FAM84AQ96KN4 292 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SPON2Q9BUD6 331 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SHISA3A0PJX4 238 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 UBOX5O94941 541 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CLCQ05315 142 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 TOX2Q96NM4 488 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 RICTORQ6R327 1708 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NCOA1Q15788 1441 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 KDM6BO15054 1643 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ERVFC1P60507 584 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 USP48Q86UV5 1035 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 MYLIPQ8WY64 445 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 BACH2Q9BYV9 841 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 KIF15Q9NS87 1388 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 NAIPQ13075 1403 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRC-211ENST00000484135 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.91□□□□□ -1.3
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