RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 E2F5Q15329 346 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NTRK3Q16288 839 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 POTEDQ86YR6 584 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA5O75582 802 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PPARAQ07869 468 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CABS1Q96KC9 395 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PANX2Q96RD6 677 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.16■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN1Q04323 297 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 BLZF1Q9H2G9 400 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NMT2O60551 498 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MCM3P25205 808 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NR1I3Q14994 352 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC181Q5TID7 509 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RESP18Q5W5W9 173 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 KRT23Q9C075 422 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 IDEP14735 1019 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TICAM2Q86XR7 235 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 JAKMIP2Q96AA8 810 aa18.15■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NTSR2O95665 410 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TUBBP07437 444 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MYBL2P10244 700 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 USP14P54578 494 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC6O95255 1503 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TNKSO95271 1327 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RPSAP08865 295 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZPR1O75312 459 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IFT88Q13099 833 aa18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CXCR5P32302 372 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PPFIA1Q13136 1202 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IFT81Q8WYA0 676 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB4BP68371 445 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CAVIN4Q5BKX8 364 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC114Q96M63 670 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PLCD1P51178 756 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FANCBQ8NB91 859 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf37Q96NL8 207 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 HSF2BPO75031 334 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GYPCP04921 128 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-24P63145 666 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB2AQ13885 445 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 NAA25Q14CX7 972 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RASGRP2Q7LDG7 609 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FBXL16Q8N461 479 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SHANK3Q9BYB0 1731 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L12C9JPN9 530 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 USP17L21D6R901 530 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PPP6R2O75170 966 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 KCNV1Q6PIU1 500 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ABCC12Q96J65 1359 aa18.12■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHA8P1O95397 391 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CYP27A1Q02318 531 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PTPAQ15257 358 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 DONSONQ9NYP3 566 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ODF2LQ9ULJ1 636 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 PARP10Q53GL7 1025 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA1Q5VX52 437 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 HPSEQ9Y251 543 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2D6P10635 497 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 EPSTI1Q96J88 318 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.11■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.1■□□□□ 0.49
CCSAP-204ENST00000483092 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms