RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 RNF208Q9H0X6 261 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR7Q9Y216 660 aa23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CYP21A2P08686 494 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 EN2P19622 333 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD1Q719H9 257 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 FAM160B2Q86V87 743 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 DCAF4Q8WV16 495 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.42■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G6O60733 806 aa23.41■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 COPB2P35606 906 aa23.41■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.41■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 DGKHQ86XP1 1220 aa23.41■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.41■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 GJB1P08034 283 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 HOXC6P09630 235 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 FDX1P10109 184 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ADORA2AP29274 412 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 TRDNQ13061 729 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CCL14Q16627 93 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC96Q2M329 555 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 DPP9Q86TI2 863 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 CPXCR1Q8N123 301 aa23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ATP2A1O14983 1001 aa23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 FCER1AP12319 257 aa23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM32Q13049 653 aa23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 PDHBP11177 359 aa23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 OAZ1P54368 228 aa23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 CASC1Q6TDU7 716 aa23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ANKS1AQ92625 1134 aa23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 TNKSO95271 1327 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 RPTORQ8N122 1335 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 CDC45O75419 566 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 GJA8P48165 433 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 MMP19Q99542 508 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 RIPK3Q9Y572 518 aa23.37■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 E7EWF7 191 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 COBLO75128 1261 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SLC4A3P48751 1232 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 KCTD2Q14681 263 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 PNMA1Q8ND90 353 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 KAT14Q9H8E8 782 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.36■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SNHG28P0DPA3 235 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 DEFB118Q96PH6 123 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.35■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SGPL1O95470 568 aa23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SLC16A2P36021 539 aa23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF543Q08ER8 600 aa23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 NCOA7Q8NI08 942 aa23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SHISA4Q96DD7 197 aa23.34■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.33■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.33■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.33■■□□□ 1.33
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF536O15090 1300 aa23.33■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 SNAP25P60880 206 aa23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 SEC23AQ15436 765 aa23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC174Q6PII3 467 aa23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 CHST13Q8NET6 341 aa23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO40Q9UH90 709 aa23.32■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 IGHA2P01877 340 aa23.31■■□□□ 1.32
CTPS1-206ENST00000470271 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms