RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468358.5

CLDN11-202, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 3

Gene CLDN11, Length 593 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-202ENST00000468358 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 GRB14Q14449 540 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 FAM160B2Q86V87 743 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 DCAF4Q8WV16 495 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TRIB2Q92519 343 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TTC14Q96N46 770 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 STRNO43815 780 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CYP21A2P08686 494 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 FCER1AP12319 257 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ADORA2AP29274 412 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 COPB2P35606 906 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 NOVP48745 357 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CCL14Q16627 93 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 REPS2Q8NFH8 660 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 USP6NLQ92738 828 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.37■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CDC45O75419 566 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TRIM32Q13049 653 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 MAP4K1Q92918 833 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 MMP19Q99542 508 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 KAT14Q9H8E8 782 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.36■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TNKSO95271 1327 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 FDX1P10109 184 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 KCTD2Q14681 263 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 DGKHQ86XP1 1220 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 SLC5A4Q9NY91 659 aa20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 E7EWF7 191 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 GJB1P08034 283 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 PNMA1Q8ND90 353 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 DEFB118Q96PH6 123 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.34■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 RPTORQ8N122 1335 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 PDHBP11177 359 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 SLC16A2P36021 539 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 SNAP25P60880 206 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 CCDC174Q6PII3 467 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ABRAQ8N0Z2 381 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 NCOA7Q8NI08 942 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.33■□□□□ 0.85
CLDN11-202ENST00000468358 ERICH2A1L162 156 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 ATP2A1O14983 1001 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 PLA2G6O60733 806 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 HOXC6P09630 235 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 OAZ1P54368 228 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 RIPK3Q9Y572 518 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.32■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 COBLO75128 1261 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 PGK2P07205 417 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 GJA8P48165 433 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 ZNF543Q08ER8 600 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 DDX11Q96FC9 970 aa20.31■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 SGPL1O95470 568 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 ALAS1P13196 640 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 CYP2C19P33261 490 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 FBXO40Q9UH90 709 aa20.3■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 SLC27A2O14975 620 aa20.29■□□□□ 0.84
CLDN11-202ENST00000468358 CNGA1P29973 690 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms