RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 STAT3P40763 770 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 PTH1RQ03431 593 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 TRDNQ13061 729 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 GRB14Q14449 540 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC96Q2M329 555 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CASC1Q6TDU7 716 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 DCAF4Q8WV16 495 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 MTMR7Q9Y216 660 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 MYH6P13533 1939 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 PLA2G6O60733 806 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 DGKHQ86XP1 1220 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 REPS2Q8NFH8 660 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIB2Q92519 343 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC5A4Q9NY91 659 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 GJB1P08034 283 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 FCER1AP12319 257 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD1Q719H9 257 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 DPP9Q86TI2 863 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP4K1Q92918 833 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 UBAC1Q9BSL1 405 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP1-205ENST00000466097 RPTORQ8N122 1335 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP2A1O14983 1001 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CYP21A2P08686 494 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 HOXC6P09630 235 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 EN2P19622 333 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ADORA2AP29274 412 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 OAZ1P54368 228 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CPXCR1Q8N123 301 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CDC45O75419 566 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CAPN2P17655 700 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 KCTD2Q14681 263 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MFSD14CQ5VZR4 134 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MMP19Q99542 508 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 KAT14Q9H8E8 782 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SMCHD1A6NHR9 2005 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TNKSO95271 1327 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PDHBP11177 359 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GJA8P48165 433 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC4A3P48751 1232 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CCL14Q16627 93 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PNMA1Q8ND90 353 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NCOA7Q8NI08 942 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKS1AQ92625 1134 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FBXO40Q9UH90 709 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMPD3Q5JV73 1810 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 BRCA2P51587 3418 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TRIM32Q13049 653 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 RASGRP2Q7LDG7 609 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB118Q96PH6 123 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ERICH2A1L162 156 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 E7EWF7 191 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SGPL1O95470 568 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SNHG28P0DPA3 235 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF543Q08ER8 600 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SART3Q15020 963 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 SYDE2Q5VT97 1194 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 OLFML2BQ68BL8 750 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 BTNL9Q6UXG8 535 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CHST13Q8NET6 341 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 GPCPD1Q9NPB8 672 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 MCM3APO60318 1980 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 COBLO75128 1261 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TKFCQ3LXA3 575 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 TTBK2Q6IQ55 1244 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP1-205ENST00000466097 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms