RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMLP26374 656 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 Q7L0L9 218 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 RUFY2Q8WXA3 655 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 GMCL1Q96IK5 515 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 GDF15Q99988 308 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 MROH8Q9H579 483 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 CTNNA3Q9UI47 895 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 FEM1BQ9UK73 627 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC25A27O95847 323 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 HOXC6P09630 235 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 BMP3P12645 472 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 NT5C2P49902 561 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM32Q13049 653 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 REPS2Q8NFH8 660 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.7■□□□□ 0.264e-7■■□□□ 14
SH3BP4-205ENST00000444916 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.7■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SYN1P17600 705 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 COPB2P35606 906 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 STAT3P40763 770 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC1A4P43007 532 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL14Q16627 93 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 KIFC2Q96AC6 838 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC80Q8N2C7 3258 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 NEDD4P46934 1319 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 RPTORQ8N122 1335 aa16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MCCP23508 829 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ADORA2AP29274 412 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 STAT2P52630 851 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB123Q8N688 67 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ESR2Q92731 530 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM232C9JQI7 657 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP2A1O14983 1001 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 FCER1AP12319 257 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CAPN2P17655 700 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 DPP9Q86TI2 863 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM160B2Q86V87 743 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 NPLOC4Q8TAT6 608 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SGSM2O43147 1006 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 PLA2G6O60733 806 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBED4O75132 1171 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 FDX1P10109 184 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 BMP8BP34820 402 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 RCSD1Q6JBY9 416 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CHURC1Q8WUH1 139 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 DCAF4Q8WV16 495 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TTC14Q96N46 770 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM47Q9BQJ4 181 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 COBLO75128 1261 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM4AO75164 1064 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 OAZ1P54368 228 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 IKQ13123 557 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MFSD14CQ5VZR4 134 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 OLFML2BQ68BL8 750 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD1Q719H9 257 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 RASGRP2Q7LDG7 609 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CPXCR1Q8N123 301 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC136Q96JN2 1154 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP19Q99542 508 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 MTMR7Q9Y216 660 aa16.65■□□□□ 0.26
SH3BP4-205ENST00000444916 B4E1Z4 1266 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHA2P01877 340 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PTH1RQ03431 593 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KCTD2Q14681 263 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC96Q2M329 555 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC178Q5BJE1 867 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 BMP2KLQ5H9B9 411 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 SKAP1Q86WV1 359 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 IQCA1Q86XH1 822 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 DGKHQ86XP1 1220 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KRT23Q9C075 422 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RIPK3Q9Y572 518 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms