RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 IFNB1P01574 187 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ECE1P42892 770 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 HDAC11Q96DB2 347 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ST7Q9NRC1 585 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 A6NJR5 290 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GPC4O75487 556 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BAG2O95816 211 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 APOEP02649 317 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SERPINB6P35237 376 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 IQCB1Q15051 598 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PPME1Q9Y570 386 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CSADQ9Y600 493 aa7.31□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 LIG4P49917 911 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 STX1BP61266 288 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARMC9Q7Z3E5 817 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SEPT8Q92599 483 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SPDL1Q96EA4 605 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KIF1BO60333 1816 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ATF2P15336 505 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RXRAP19793 462 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GJA3Q9Y6H8 435 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 OAS2P29728 719 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZSCAN26Q16670 478 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DCAF15Q66K64 600 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KBTBD3Q8NAB2 608 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CBX8Q9HC52 389 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MID2Q9UJV3 735 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PYGLP06737 847 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MX2P20592 715 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SLC39A6Q13433 755 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RASIP1Q5U651 963 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 EP400NLQ6ZTU2 488 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CFAP61Q8NHU2 1237 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GLG1Q92896 1179 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 EFCAB8A8MWE9 144 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CXorf38Q8TB03 319 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 MGARPQ8TDB4 240 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CCDC138Q96M89 665 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 NPATQ14207 1427 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KCNK3O14649 394 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 IFNA8P32881 189 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 GCKP35557 465 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KIF22Q14807 665 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ITGA6P23229 1130 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ELF2Q15723 593 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TNNI3KQ59H18 835 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 CUEDC2Q9H467 287 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.3□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 RLBP1P12271 317 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ADALQ6DHV7 355 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ITKQ08881 620 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 BFSP1Q12934 665 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 PPP2R5AQ15172 486 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TPH2Q8IWU9 490 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 C8orf37Q96NL8 207 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 SERPINI1Q99574 410 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 TRIM4Q9C037 500 aa7.29□□□□□ -1.24
USP46-201ENST00000441222 NBPF3Q9H094 633 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms