RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRIP1Q5VSL9 837 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TANGO6Q9C0B7 1094 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F8W031 263 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AXIN1O15169 862 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADCY3O60266 1144 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAX3P23760 479 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP4P98171 946 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR3Q13615 1198 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DLGAP5Q15398 846 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C4orf46Q504U0 113 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEPSINQ96N21 525 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PFASO15067 1338 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOSL2P15408 326 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIG1P18858 919 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXK2Q01167 660 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP100Q494V2 611 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR78Q5VTH9 848 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HELQQ8TDG4 1101 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NR3C2P08235 984 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CETPP11597 493 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NPR3P17342 541 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXD10P28358 340 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAPK1P28482 360 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FLT3LGP49771 235 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COA1Q9GZY4 146 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PNMA2Q9UL42 364 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JAG2Q9Y219 1238 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYO9BQ13459 2157 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHD9Q3L8U1 2897 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1W2PRU2 124 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDHXO00330 501 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCRP11274 1271 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMTNP53814 917 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FCGRTP55899 365 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYBPC2Q14324 1141 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT24Q2M2I5 525 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C11orf49Q9H6J7 331 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JADE2Q9NQC1 790 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSADQ9Y600 493 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COMMD10Q9Y6G5 202 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A6NJY4 79 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UPP2O95045 317 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP2C8P10632 490 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNAPC2Q13487 334 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MOGSQ13724 837 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC26Q2I0M4 334 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCDC152Q4G0S7 254 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAG2Q8N3U4 1231 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HPS1Q92902 700 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XAGE2Q96GT9 111 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB16Q96NS5 453 aa7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms