RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 TEX13BQ9BXU2 312 aa21.97■■□□□ 1.11
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.97■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC4A3P48751 1232 aa21.96■■□□□ 1.11
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAAP100Q0VG06 881 aa21.96■■□□□ 1.11
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa21.95■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa21.95■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.94■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.94■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCM3APO60318 1980 aa21.93■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYADML2A6NDP7 307 aa21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 F5H6K3 240 aa21.92■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 KLRC3Q07444 240 aa21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRIN2CQ14957 1233 aa21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 NYAP2Q9P242 653 aa21.92■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.91■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.91■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SBK1Q52WX2 424 aa21.9■■□□□ 1.1
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD35Q8N283 1001 aa21.9■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 TIFAQ96CG3 184 aa21.9■■□□□ 1.1
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GSG1L2A8MUP6 293 aa21.89■■□□□ 1.09
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UPK3BP1-201ENST00000428678 MFSD5Q6N075 450 aa21.89■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.89■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF576Q9H609 170 aa21.89■■□□□ 1.09
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP2A1O14983 1001 aa21.88■■□□□ 1.09
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ASGR1P07306 291 aa21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC174Q6PII3 467 aa21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP38Q8NB14 1042 aa21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.88■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ADCY6O43306 1168 aa21.87■■□□□ 1.09
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UPK3BP1-201ENST00000428678 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO40Q9UH90 709 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 FEM1BQ9UK73 627 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCOR1O75376 2440 aa21.87■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDM1O75626 825 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 CSF2RAP15509 400 aa21.86■■□□□ 1.09
UPK3BP1-201ENST00000428678 TDO2P48775 406 aa21.86■■□□□ 1.09
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