RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IQCA1Q86XH1 822 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DCAF4Q8WV16 495 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANKS1AQ92625 1134 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.4■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLA2G6O60733 806 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CDC45O75419 566 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC25A27O95847 323 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.39■■■□□ 2.3
HOXD-AS2-201ENST00000426965 E7EWF7 191 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATP2A1O14983 1001 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZBED4O75132 1171 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HMGCRP04035 888 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDHBP11177 359 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTBK2Q6IQ55 1244 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM160B2Q86V87 743 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHURC1Q8WUH1 139 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 APBA2Q99767 749 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RIPK3Q9Y572 518 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STRNO43815 780 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXC6P09630 235 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNHG28P0DPA3 235 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADORA2AP29274 412 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC96Q2M329 555 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CPXCR1Q8N123 301 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNKSO95271 1327 aa29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COBLO75128 1261 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF208Q9H0X6 261 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRR12Q9ULL5 1215 aa29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.35■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC16A2P36021 539 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SNAP25P60880 206 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRDNQ13061 729 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NECTIN1Q15223 517 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SEC23AQ15436 765 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTNL9Q6UXG8 535 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPCPD1Q9NPB8 672 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF536O15090 1300 aa29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC27A2O14975 620 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IGHA2P01877 340 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FDX1P10109 184 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FCER1AP12319 257 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 OAZ1P54368 228 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF543Q08ER8 600 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CASC1Q6TDU7 716 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PNMA1Q8ND90 353 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJB1P08034 283 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COPB2P35606 906 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CREB3L3Q68CJ9 461 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DPP9Q86TI2 863 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCOA7Q8NI08 942 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SHISA4Q96DD7 197 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KAT14Q9H8E8 782 aa29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC4A3P48751 1232 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHST3Q7LGC8 479 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MMP19Q99542 508 aa29.31■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOLGA8HP0CJ92 632 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ANTXR2P58335 489 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RPTORQ8N122 1335 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PGK2P07205 417 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJA8P48165 433 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC174Q6PII3 467 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SENP2Q9HC62 589 aa29.29■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCTD2Q14681 263 aa29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms