RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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HTATSF1-202ENST00000425695 CCL14Q16627 93 aa29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1-202ENST00000425695 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIB2Q92519 343 aa29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
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HTATSF1-202ENST00000425695 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.39■■■□□ 2.3
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HTATSF1-202ENST00000425695 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.37■■■□□ 2.29
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HTATSF1-202ENST00000425695 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1-202ENST00000425695 KAT14Q9H8E8 782 aa29.36■■■□□ 2.29
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HTATSF1-202ENST00000425695 SNHG28P0DPA3 235 aa29.3■■■□□ 2.28
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HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2C19P33261 490 aa29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 GJA8P48165 433 aa29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 CPVLQ9H3G5 476 aa29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1-202ENST00000425695 SGPL1O95470 568 aa29.28■■■□□ 2.28
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