RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417612.1

CHL1-AS1-201, CHL1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHL1-AS1, Length 913 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MECOMQ03112 1051 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 FOXC1Q12948 553 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TNFAIP1Q13829 316 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SCARF1Q14162 830 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 FAM26DQ5JW98 314 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 AIDAQ96BJ3 306 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MYO19Q96H55 970 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ZNF408Q9H9D4 720 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 USP40Q9NVE5 1235 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ZNF232Q9UNY5 417 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SNED1Q8TER0 1413 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 AOX1Q06278 1338 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SALL1Q9NSC2 1324 aa8.51□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CLRN2A0PK11 232 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SERTM1A2A2V5 107 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SBF1O95248 1867 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 IGHA2P01877 340 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NR3C2P08235 984 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 BTDP43251 543 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NR5A1Q13285 461 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PICALMQ13492 652 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CERS3Q8IU89 383 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 EDEM1Q92611 657 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ANTXR1Q9H6X2 564 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.5□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 LTBP1Q14766 1721 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 A0A1B0GUL6 1792 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CDK2AP1O14519 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HSPA6P17066 643 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 DAB2P98082 770 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 DGKZQ13574 1117 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TTC22Q5TAA0 569 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 LDHDQ86WU2 507 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TEX11Q8IYF3 940 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CERS5Q8N5B7 392 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SMC1BQ8NDV3 1235 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 UBXN4Q92575 508 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 GGA3Q9NZ52 723 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 STAP2Q9UGK3 403 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.49□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 SHTN1A0MZ66 631 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 EML1O00423 815 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PDE6AP16499 860 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PKDCCQ504Y2 493 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 KRT26Q7Z3Y9 468 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HOOK2Q96ED9 719 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 COL4A5P29400 1685 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.48□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 WNT10BO00744 389 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TOMM70O94826 608 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HLA-DOAP06340 250 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TDO2P48775 406 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 TCP10Q12799 353 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 USP48Q86UV5 1035 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.47□□□□□ -1.05
CHL1-AS1-201ENST00000417612 GJD3Q8N144 294 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms