RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412654.1

PCA3-201, Transcript of prostate cancer associated 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCA3, Length 3,922 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCA3-201ENST00000412654 AK8Q96MA6 479 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NUP58Q9BVL2 599 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 H7C1D1 291 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CCDC102BQ68D86 513 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LPIN2Q92539 896 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 MYD88Q99836 296 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 GPAA1O43292 621 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 HERVK_113P62684 666 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ALS2CLQ60I27 953 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TSC1Q92574 1164 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 P3H4Q92791 437 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SENP2Q9HC62 589 aa6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CBX1P83916 185 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SCARF1Q14162 830 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SEPT2Q15019 361 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SMARCE1Q969G3 411 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PNKPQ96T60 521 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 FAM107BQ9H098 131 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 H0YGN5 161 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 EDIL3O43854 480 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PPFIA4O75335 1185 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 GFPT2O94808 682 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CCDC175P0C221 793 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SNHG28P0DPA3 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TDO2P48775 406 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LRRC31Q6UY01 552 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NFS1Q9Y697 457 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TMEM232C9JQI7 657 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ATP1A3P13637 1013 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ALADP13716 330 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 NPEPPSP55786 919 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 UBASH3AP57075 661 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 IQCKQ8N0W5 287 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 COG1Q8WTW3 980 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ANK1P16157 1881 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PDE6AP16499 860 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 EIF5P55010 431 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LRRC24Q50LG9 513 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CENPPQ6IPU0 288 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 KDM7AQ6ZMT4 941 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 TMTC3Q6ZXV5 915 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 CREG2Q8IUH2 290 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.69□□□□□ -1.34
PCA3-201ENST00000412654 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.69□□□□□ -1.34
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