RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 FEZ1Q99689 392 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 BARHL2Q9NY43 387 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 PTPRAP18433 802 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 MOB2Q70IA6 237 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 BRAPQ7Z569 592 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.316e-10■■■■□ 23.1
ODC1-202ENST00000405333 RRAGCQ9HB90 399 aa23.21■■□□□ 1.31
ODC1-202ENST00000405333 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 NLRP5P59047 1200 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.33e-6■■■□□ 16
ODC1-202ENST00000405333 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 COA7Q96BR5 231 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TRAK2O60296 914 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 MTMR2Q13614 643 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PICK1Q9NRD5 415 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.2■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 KRT2P35908 639 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SPP2Q13103 211 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 MTMR8Q96EF0 704 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CLIC4Q9Y696 253 aa23.19■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 VGLL4Q14135 290 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 GPT2Q8TD30 523 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SH2D4AQ9H788 454 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SH3GLB2Q9NR46 395 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TRIM75PA6NK02 468 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 NAPAP54920 295 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TNFRSF25Q93038 417 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SPATA32Q96LK8 384 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.18■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TRAF5O00463 557 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZBTB5O15062 677 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 GINM1Q9NU53 330 aa23.17■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 STAT2P52630 851 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 BTNL9Q6UXG8 535 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CFAP45Q9UL16 551 aa23.16■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 BLIDQ8IZY5 108 aa23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 PCDHA4Q9UN74 947 aa23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 WNT7AO00755 349 aa23.14■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 MAP3K9P80192 1104 aa23.14■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 KIFC2Q96AC6 838 aa23.14■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 WDR18Q9BV38 432 aa23.14■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.14■■□□□ 1.3
ODC1-202ENST00000405333 SMCO2A6NFE2 343 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 M0R2N6 131 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 ATP2B1P20020 1258 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 BACE1P56817 501 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.14■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 VCAM1P19320 739 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 CALML3P27482 149 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 PGBD1Q96JS3 809 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.13■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 HMGCS2P54868 508 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 ANO1Q5XXA6 986 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 ELP1O95163 1332 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 ATL3Q6DD88 541 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.12■■□□□ 1.29
ODC1-202ENST00000405333 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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