RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRN2-201ENST00000389413 PTPREP23469 700 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRN2-201ENST00000389413 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRN2-201ENST00000389413 COBLO75128 1261 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 HPDP32754 393 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CALCOCO2Q13137 446 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MFSD14BQ5SR56 506 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM23A6NLE4 172 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 FOXO4P98177 505 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GRIPAP1Q4V328 841 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 USP32Q8NFA0 1604 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CHMP2AO43633 222 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PANX2Q96RD6 677 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 STK36Q9NRP7 1315 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 EPSTI1Q96J88 318 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC39A2Q9NP94 309 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PAGE5Q96GU1 130 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MED4Q9NPJ6 270 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ACTN2P35609 894 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CLCN6P51797 869 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 LONRF2Q1L5Z9 754 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC114Q96M63 670 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 VEZTQ9HBM0 779 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SOWAHDA6NJG2 315 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R7Q15435 360 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 RUFY4Q6ZNE9 571 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC25Q86WR0 208 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHA12Q9UN75 941 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PARP3Q9Y6F1 533 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PALLDQ8WX93 1383 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 EEF2KMTQ96G04 330 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 AK8Q96MA6 479 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 UIMC1Q96RL1 719 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 HLFQ16534 295 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MSL1Q68DK7 614 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PDE11AQ9HCR9 933 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC151A5D8V7 595 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 B4DLN1 442 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ATG9AQ7Z3C6 839 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SYCE1Q8N0S2 351 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 RETREG2Q8NC44 543 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 RASGRP4Q8TDF6 673 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 LMTK3Q96Q04 1460 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MYL1P05976 194 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PEX26Q7Z412 305 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCC12Q96J65 1359 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GPBP1Q86WP2 473 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC50Q8IVM0 306 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM71BQ8TC56 605 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ISCA1Q9BUE6 129 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SH2D4AQ9H788 454 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ATP2A1O14983 1001 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GCNT3O95395 438 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 NEDD4P46934 1319 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ARHGEF35A5YM69 484 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SPOPO43791 374 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GPATCH11Q8N954 259 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 KCNF1Q9H3M0 494 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF609O15014 1411 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRN2-201ENST00000389413 GJC1P36383 396 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms