RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371746.7

LHX3-201, Transcript of LIM homeobox 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LHX3, Length 2,403 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3-201ENST00000371746 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 SMCO2A6NFE2 343 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 CFAP100Q494V2 611 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 ASPRV1Q53RT3 343 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 KCNA3P22001 575 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 SMARCA1P28370 1054 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 CCDC93Q567U6 631 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 MYH8P13535 1937 aa27.03■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.03■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 RAD17O75943 681 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 AFMP43652 599 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 ZNF543Q08ER8 600 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.02■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 SMARCE1Q969G3 411 aa27.01■■□□□ 1.92
LHX3-201ENST00000371746 SLFN14P0C7P3 912 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CASP1P29466 404 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CDC25AP30304 524 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CCDC144BQ3MJ40 725 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CCDC17Q96LX7 622 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 C6orf50Q9HD87 102 aa27.01■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 RAD21O60216 631 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CDC25BP30305 580 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SARSP49591 514 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SOGA3Q5TF21 947 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 KANK3Q6NY19 840 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 KCTD1Q719H9 257 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 COA7Q96BR5 231 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TMEM60Q9H2L4 133 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SLC16A2P36021 539 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CCDC96Q2M329 555 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 RTKN2Q8IZC4 609 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 HSD3B7Q9H2F3 369 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 UTRNP46939 3433 aa27■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 GNA11P29992 359 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SIPA1L1O43166 1804 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SMTNL1A8MU46 457 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TPM3P06753 285 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 LRMPQ12912 555 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 PAGE5Q96GU1 130 aa26.99■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 IKBKBO14920 756 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 STAMQ92783 540 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 JMJD4Q9H9V9 463 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 PSMD14O00487 310 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 GDF11O95390 407 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 ATP1A3P13637 1013 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 EEF2P13639 858 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 MYL5Q02045 173 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 PSMD1Q99460 953 aa26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 COL4A5P29400 1685 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SPATA20Q8TB22 786 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TMEM260Q9NX78 707 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 NPM3O75607 178 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 MORC3Q14149 939 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SEPT2Q15019 361 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 LETM2Q2VYF4 491 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 SMC2O95347 1197 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TPM4P67936 248 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 E2F4Q16254 413 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 TATDN1Q6P1N9 297 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 IFNKQ9P0W0 207 aa26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
LHX3-201ENST00000371746 CLRN2A0PK11 232 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 OFD1O75665 1012 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 ZBTB7AO95365 584 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 DTHD1Q6ZMT9 781 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 PP2D1A8MPX8 630 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.95■■□□□ 1.9
LHX3-201ENST00000371746 CSRNP1Q96S65 589 aa26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms