RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF174Q15697 407 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SHISA4Q96DD7 197 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 DOCK2Q92608 1830 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SKOR1P84550 965 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.67■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM89AQ96GI7 184 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 RUFY1Q96T51 708 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PRCPP42785 496 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 TDO2P48775 406 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 EHD4Q9H223 541 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ARMT1Q9H993 441 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 COL18A1P39060 1754 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ALS2Q96Q42 1657 aa22.66■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PHKA1P46020 1223 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PTGDRQ13258 359 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ALS2CLQ60I27 953 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 WNT7AO00755 349 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 GNAT2P19087 354 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 DNM2P50570 870 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 EPHB4P54760 987 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K12Q12852 859 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PKN1Q16512 942 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 MTRQ99707 1265 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 NUP58Q9BVL2 599 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 THAP9Q9H5L6 903 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 GDAQ9Y2T3 454 aa22.65■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGA6P23229 1130 aa22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 SNX12Q9UMY4 172 aa22.64■■□□□ 1.22
PPP1CC-201ENST00000335007 RCCD1A6NED2 376 aa22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 KIF5AQ12840 1032 aa22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 EMBQ6PCB8 327 aa22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 RETREG2Q8NC44 543 aa22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 PAPPAQ13219 1627 aa22.64■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 HSF2BPO75031 334 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA0754O94854 1291 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ADSSL1Q8N142 457 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 CREG2Q8IUH2 290 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM58Q8NG06 486 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFRSF25Q93038 417 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 BCORQ6W2J9 1755 aa22.63■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFAB1O14561 156 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 PDE8BO95263 885 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP2K2P36507 400 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 VAV2P52735 878 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM1O75626 825 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 SRGNP10124 158 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TTYH3Q9C0H2 523 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 SAMM50Q9Y512 469 aa22.62■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 PRLRP16471 622 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBED6P86452 979 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 CAVIN3Q969G5 261 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC1Q9NV70 894 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TACC1O75410 805 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFRSF8P28908 595 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 TTMPQ5BVD1 217 aa22.61■■□□□ 1.21
PPP1CC-201ENST00000335007 GREM2Q9H772 168 aa22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms