RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.58■■□□□ 1.37
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RALGPS1-202ENST00000319107 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.58■■□□□ 1.37
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RALGPS1-202ENST00000319107 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 CALM2P0DP24 149 aa23.55■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.55■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.55■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 EVCP57679 992 aa23.54■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 MICU3Q86XE3 530 aa23.54■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 AK2P54819 239 aa23.53■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.53■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 PRMT2P55345 433 aa23.52■■□□□ 1.36
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RALGPS1-202ENST00000319107 SYDE2Q5VT97 1194 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 MB21D1Q8N884 522 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.52■■□□□ 1.36
RALGPS1-202ENST00000319107 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 VWA5AO00534 786 aa23.51■■□□□ 1.35
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RALGPS1-202ENST00000319107 SLC16A2P36021 539 aa23.51■■□□□ 1.35
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RALGPS1-202ENST00000319107 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.51■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 KLRF2D3W0D1 207 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 PSMC4P43686 418 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 IL27Q8NEV9 243 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 REPS2Q8NFH8 660 aa23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 FCGRTP55899 365 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 CAP1Q01518 475 aa23.49■■□□□ 1.35
RALGPS1-202ENST00000319107 RTN1Q16799 776 aa23.49■■□□□ 1.35
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