RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.08■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 PDRG1Q9NUG6 133 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXD4-201ENST00000306324 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa26.08■■□□□ 1.77
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HOXD4-201ENST00000306324 MICU3Q86XE3 530 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.06■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa26.05■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 MAD2L2Q9UI95 211 aa26.05■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD4-201ENST00000306324 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 NEK4P51957 841 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXD4-201ENST00000306324 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.03■■□□□ 1.76
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HOXD4-201ENST00000306324 CCDC174Q6PII3 467 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 FANCBQ8NB91 859 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 REPS2Q8NFH8 660 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.01■■□□□ 1.75
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 SLC4A3P48751 1232 aa26■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRF4Q8IZF3 695 aa26■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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HOXD4-201ENST00000306324 PSMC4P43686 418 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 AK2P54819 239 aa25.99■■□□□ 1.75
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HOXD4-201ENST00000306324 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
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HOXD4-201ENST00000306324 RTN1Q16799 776 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 WDR78Q5VTH9 848 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 EFCC1Q9HA90 598 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CTGFP29279 349 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 GNAQP50148 359 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 FCGRTP55899 365 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXD4-201ENST00000306324 CAP1Q01518 475 aa25.98■■□□□ 1.75
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